入国自体は可能です。 ただし、タイ入国時に入国管理局/イミグレーションから説明を求められる可能性があります。 大使館上では、あくまでも申請時に提示したルート・航空券(日本からタイ入国)での登録がされており、登録内容に変更・相違がある場合、追加説明が必要となる場合があります。 その場合、あくまでも当日の担当官の判断、及び本人の責任となりますのでご留意ください。
また、上記はあくまでも「VISA取得後に急遽出張が決まった」という旨を担当官にご説明頂く形となります。 弊社では念のため当初の申告通り日本から出国頂くことを推奨させて頂いております。